明代以圩名置防城巡司，清设防城县。
　　1958年5月1日成立东兴各族自治县，属广东省管辖。1965年防城各族自治县划归广西管辖。1978年12月25日防城各族自治县更名为防城各族自治县。
　　1993年5月23日，国务院批准，撤销防城各族自治县，设立防城港市（地级）、港口区、防城区，将钦州地区的上思县划归防城港市。即：撤销防城各族自治县和防城港区，设立地级防城港市和港口区、防城区。原防城各族自治县划分为防城区和东兴经济开发区（县级）。

　　1996年4月29日，民政部批准（民行批[1996]26号）设立东兴市（县级），以防城港市防城区的东兴、江平、马路3个镇的行政区域为东兴市的行政区域，市人民政府驻东兴镇。
　　
　　2000年，据第五次全国人口普查数据：防城港市总人口735952人。其中：港口区 106403人、防城区 316111人、上思县 205307人、东兴市 108131人。